Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAT8

Fbxo48, F-box only protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo48Q8CAT8 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Fbxo48Q8CAT8 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms