Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

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Length 508 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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FarsaQ8C0C7 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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FarsaQ8C0C7 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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FarsaQ8C0C7 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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FarsaQ8C0C7 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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FarsaQ8C0C7 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
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FarsaQ8C0C7 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
FarsaQ8C0C7 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
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