Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Ctdsp2Q8BX07 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms