Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
H2-M10.4Q85ZW8 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms