Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Clec18aQ7TSQ1 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Clec18aQ7TSQ1 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Clec18aQ7TSQ1 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Clec18aQ7TSQ1 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Clec18aQ7TSQ1 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Clec18aQ7TSQ1 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Clec18aQ7TSQ1 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Clec18aQ7TSQ1 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91 ms