Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Uhrf2Q7TMI3 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
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Uhrf2Q7TMI3 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Uhrf2Q7TMI3 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
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