Protein–RNA interactions for Protein: Q78J03

Msrb2, Methionine-R-sulfoxide reductase B2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msrb2Q78J03 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Msrb2Q78J03 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Msrb2Q78J03 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Msrb2Q78J03 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Msrb2Q78J03 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Msrb2Q78J03 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Msrb2Q78J03 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Msrb2Q78J03 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Msrb2Q78J03 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Msrb2Q78J03 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Msrb2Q78J03 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Msrb2Q78J03 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Msrb2Q78J03 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Msrb2Q78J03 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Msrb2Q78J03 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Msrb2Q78J03 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Msrb2Q78J03 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Msrb2Q78J03 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Msrb2Q78J03 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Msrb2Q78J03 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Msrb2Q78J03 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Msrb2Q78J03 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Msrb2Q78J03 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Msrb2Q78J03 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Msrb2Q78J03 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Msrb2Q78J03 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Msrb2Q78J03 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Msrb2Q78J03 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Msrb2Q78J03 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Msrb2Q78J03 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Msrb2Q78J03 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Msrb2Q78J03 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Msrb2Q78J03 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Msrb2Q78J03 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Msrb2Q78J03 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Msrb2Q78J03 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Msrb2Q78J03 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Msrb2Q78J03 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Msrb2Q78J03 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Msrb2Q78J03 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Msrb2Q78J03 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Msrb2Q78J03 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Msrb2Q78J03 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Msrb2Q78J03 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Msrb2Q78J03 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Msrb2Q78J03 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Msrb2Q78J03 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Msrb2Q78J03 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Msrb2Q78J03 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Msrb2Q78J03 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Msrb2Q78J03 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Msrb2Q78J03 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Msrb2Q78J03 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Msrb2Q78J03 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Msrb2Q78J03 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Msrb2Q78J03 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Msrb2Q78J03 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Msrb2Q78J03 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Msrb2Q78J03 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Msrb2Q78J03 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Msrb2Q78J03 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Msrb2Q78J03 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Msrb2Q78J03 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Msrb2Q78J03 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Msrb2Q78J03 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Msrb2Q78J03 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Msrb2Q78J03 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Msrb2Q78J03 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Msrb2Q78J03 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Msrb2Q78J03 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Msrb2Q78J03 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Msrb2Q78J03 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Msrb2Q78J03 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Msrb2Q78J03 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Msrb2Q78J03 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Msrb2Q78J03 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Msrb2Q78J03 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Msrb2Q78J03 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Msrb2Q78J03 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Msrb2Q78J03 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Msrb2Q78J03 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Msrb2Q78J03 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Msrb2Q78J03 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Msrb2Q78J03 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Msrb2Q78J03 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Msrb2Q78J03 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Msrb2Q78J03 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Msrb2Q78J03 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Msrb2Q78J03 1700006J14Rik-204ENSMUST00000161511 574 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Msrb2Q78J03 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Msrb2Q78J03 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Msrb2Q78J03 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Msrb2Q78J03 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Msrb2Q78J03 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Msrb2Q78J03 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Msrb2Q78J03 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Msrb2Q78J03 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Msrb2Q78J03 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Msrb2Q78J03 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Msrb2Q78J03 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms