Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Dip2a-205ENSMUST00000160048 6551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
CltbQ6IRU5 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms