Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Klf3Q60980 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms