Protein–RNA interactions for Protein: Q60974

Ncor1, Nuclear receptor corepressor 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncor1Q60974 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Gm37270-201ENSMUST00000194277 330 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Gm4866-201ENSMUST00000197408 589 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 CT009713.2-201ENSMUST00000225532 1149 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Ssna1-201ENSMUST00000028342 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Zwilch-209ENSMUST00000176299 1831 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Amd-ps3-201ENSMUST00000072796 1496 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 4933427I22Rik-202ENSMUST00000153921 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Gm15258-201ENSMUST00000153801 741 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Rab26-204ENSMUST00000176533 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Gm44420-201ENSMUST00000203669 490 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Olfr456-201ENSMUST00000057251 1052 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Gm10689-201ENSMUST00000098864 432 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Ncor1Q60974 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Ncor1Q60974 Snrnp27-201ENSMUST00000001186 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Gm8577-201ENSMUST00000122420 986 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Gm14145-201ENSMUST00000133385 508 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Ncor1Q60974 Tead1-211ENSMUST00000170352 1218 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Vmn2r-ps7-201ENSMUST00000176244 1098 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
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Ncor1Q60974 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Ncor1Q60974 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Ncor1Q60974 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Ncor1Q60974 Gzmg-201ENSMUST00000015578 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Sectm1b-206ENSMUST00000168459 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Ncor1Q60974 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Tssk4-204ENSMUST00000226591 1243 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Ncor1Q60974 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Gm45110-201ENSMUST00000205704 1402 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Gm12254-201ENSMUST00000134617 471 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 4933439K11Rik-202ENSMUST00000140307 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Gm9553-201ENSMUST00000185703 996 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Gm8525-201ENSMUST00000189674 861 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Gm37622-201ENSMUST00000192162 285 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ncor1Q60974 CT025538.1-201ENSMUST00000223638 369 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
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