Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 D730050B12Rik-201ENSMUST00000223149 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnot7Q60809 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Gm26368-201ENSMUST00000157826 118 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Gm25998-201ENSMUST00000175397 53 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Nps-202ENSMUST00000210697 1082 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Gpr137b-ps-202ENSMUST00000220647 1159 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cnot7Q60809 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms