Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 2210010C04Rik-201ENSMUST00000031931 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Tro-201ENSMUST00000087253 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Eea1-201ENSMUST00000053484 7749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Olfr243-202ENSMUST00000215723 4735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Lingo1-206ENSMUST00000210032 3627 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Ccdc187-202ENSMUST00000217256 9411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Anapc15-213ENSMUST00000178851 2797 ntTSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Oprm1-204ENSMUST00000063036 1427 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Gpatch2-202ENSMUST00000065573 4547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Car12-201ENSMUST00000071889 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Brpf1-208ENSMUST00000203577 4468 ntTSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Kat6b-207ENSMUST00000182855 6791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Uimc1-204ENSMUST00000127195 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Cd2bp2-203ENSMUST00000205316 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Atp1a3-202ENSMUST00000102858 3895 ntTSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Tmprss3-202ENSMUST00000114549 2872 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Bloc1s5-201ENSMUST00000035899 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Setmar-201ENSMUST00000049246 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Rpgr-202ENSMUST00000072393 2380 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Dgcr2-201ENSMUST00000012152 4045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Boc-201ENSMUST00000114634 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Ifi211-201ENSMUST00000009340 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Plekhg5-201ENSMUST00000084115 4113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Synpo2-203ENSMUST00000106427 6937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Olfr707-205ENSMUST00000214112 1735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Lrtm2-201ENSMUST00000068351 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Man1b1-201ENSMUST00000042390 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 4933408B17Rik-201ENSMUST00000056932 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Zfp780b-201ENSMUST00000081618 3004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Txndc16-205ENSMUST00000139526 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Znrf1-202ENSMUST00000166859 3650 ntTSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Lrfn5-202ENSMUST00000119481 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Cfap61-204ENSMUST00000126415 2256 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 AC131029.1-201ENSMUST00000226391 2929 ntBASIC8.36□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Cxcr2-201ENSMUST00000027372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Pcdh18-202ENSMUST00000191794 5146 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Gm26690-201ENSMUST00000181457 1997 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Tnc-204ENSMUST00000107377 7100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Wars-205ENSMUST00000161410 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Gm10425-201ENSMUST00000181085 3364 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Lrat-201ENSMUST00000029632 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Aebp1-202ENSMUST00000109829 2541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Fam71e2-202ENSMUST00000174409 2716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
Trappc1Q5NCF2 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 253.1 ms