Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Skap2Q3UND0 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms