Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9F6

Rnf166, RING finger protein 166, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf166Q3U9F6 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Lgals1-ps2-201ENSMUST00000170221 519 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Astx1c-201ENSMUST00000177724 1150 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Astx1b-201ENSMUST00000178608 1150 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Astx2-201ENSMUST00000179135 1150 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Astx1a-201ENSMUST00000179529 1150 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Astx5-201ENSMUST00000179723 1150 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Astx6-201ENSMUST00000180281 1150 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Gm28784-201ENSMUST00000187817 1011 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Gm18426-201ENSMUST00000191874 973 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Gm42502-201ENSMUST00000198550 1089 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Gm7554-201ENSMUST00000202282 574 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Gm6261-201ENSMUST00000204707 760 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Senp7-201ENSMUST00000049128 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Vmn1r203-201ENSMUST00000091729 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Vmn1r125-201ENSMUST00000098739 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Trim12a-203ENSMUST00000106839 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Stxbp4-203ENSMUST00000107875 1660 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Scoc-201ENSMUST00000081506 1791 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Gm10307-201ENSMUST00000189839 1337 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Rnf166Q3U9F6 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Rnf166Q3U9F6 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Rnf166Q3U9F6 St8sia3os-203ENSMUST00000127716 667 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 1700028K03Rik-202ENSMUST00000159902 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Rnf166Q3U9F6 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Rnf166Q3U9F6 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Gm43580-201ENSMUST00000202892 284 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
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Rnf166Q3U9F6 AC192616.1-201ENSMUST00000221922 132 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
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Rnf166Q3U9F6 AC158142.3-201ENSMUST00000226230 675 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Olfr844-201ENSMUST00000054106 930 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Olfr310-201ENSMUST00000081918 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Olfr641-201ENSMUST00000098183 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnf166Q3U9F6 Cts3-202ENSMUST00000223815 1367 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.7 ms