Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Ccndbp1Q3TVC7 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
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Ccndbp1Q3TVC7 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Ccndbp1Q3TVC7 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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Ccndbp1Q3TVC7 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Ccndbp1Q3TVC7 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
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