Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF2

Tmem52b, Transmembrane protein 52B, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem52bQ0VBF2 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Tmem52bQ0VBF2 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Tmem52bQ0VBF2 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Tmem52bQ0VBF2 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Tmem52bQ0VBF2 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Tmem52bQ0VBF2 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Tmem52bQ0VBF2 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Tmem52bQ0VBF2 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Tmem52bQ0VBF2 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Tmem52bQ0VBF2 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Tmem52bQ0VBF2 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Tmem52bQ0VBF2 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Tmem52bQ0VBF2 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Tmem52bQ0VBF2 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Tmem52bQ0VBF2 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Tmem52bQ0VBF2 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Tmem52bQ0VBF2 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Tmem52bQ0VBF2 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Tmem52bQ0VBF2 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Tmem52bQ0VBF2 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Tmem52bQ0VBF2 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Tmem52bQ0VBF2 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Tmem52bQ0VBF2 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Tmem52bQ0VBF2 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Tmem52bQ0VBF2 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Tmem52bQ0VBF2 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Tmem52bQ0VBF2 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Tmem52bQ0VBF2 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Tmem52bQ0VBF2 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Tmem52bQ0VBF2 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Tmem52bQ0VBF2 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Tmem52bQ0VBF2 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Tmem52bQ0VBF2 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Tmem52bQ0VBF2 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Tmem52bQ0VBF2 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Tmem52bQ0VBF2 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Tmem52bQ0VBF2 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Tmem52bQ0VBF2 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Tmem52bQ0VBF2 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Tmem52bQ0VBF2 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Tmem52bQ0VBF2 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Tmem52bQ0VBF2 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Tmem52bQ0VBF2 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tmem52bQ0VBF2 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tmem52bQ0VBF2 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tmem52bQ0VBF2 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tmem52bQ0VBF2 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tmem52bQ0VBF2 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tmem52bQ0VBF2 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tmem52bQ0VBF2 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tmem52bQ0VBF2 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tmem52bQ0VBF2 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tmem52bQ0VBF2 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tmem52bQ0VBF2 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tmem52bQ0VBF2 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tmem52bQ0VBF2 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Tmem52bQ0VBF2 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tmem52bQ0VBF2 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Tmem52bQ0VBF2 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tmem52bQ0VBF2 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tmem52bQ0VBF2 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Tmem52bQ0VBF2 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tmem52bQ0VBF2 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tmem52bQ0VBF2 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Tmem52bQ0VBF2 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tmem52bQ0VBF2 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tmem52bQ0VBF2 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tmem52bQ0VBF2 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tmem52bQ0VBF2 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tmem52bQ0VBF2 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tmem52bQ0VBF2 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tmem52bQ0VBF2 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tmem52bQ0VBF2 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tmem52bQ0VBF2 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tmem52bQ0VBF2 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tmem52bQ0VBF2 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tmem52bQ0VBF2 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tmem52bQ0VBF2 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tmem52bQ0VBF2 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tmem52bQ0VBF2 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tmem52bQ0VBF2 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tmem52bQ0VBF2 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tmem52bQ0VBF2 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tmem52bQ0VBF2 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tmem52bQ0VBF2 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tmem52bQ0VBF2 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tmem52bQ0VBF2 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tmem52bQ0VBF2 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tmem52bQ0VBF2 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tmem52bQ0VBF2 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tmem52bQ0VBF2 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tmem52bQ0VBF2 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tmem52bQ0VBF2 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tmem52bQ0VBF2 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tmem52bQ0VBF2 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tmem52bQ0VBF2 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Tmem52bQ0VBF2 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Tmem52bQ0VBF2 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Tmem52bQ0VBF2 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Tmem52bQ0VBF2 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms