Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Cbx3-ps5-201ENSMUST00000091545 544 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Cbx3-ps2-201ENSMUST00000099421 544 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Gm9-201ENSMUST00000101636 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Psme2-201ENSMUST00000111378 795 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Madcam1-202ENSMUST00000217748 944 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Gm46349-201ENSMUST00000219678 917 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Gm14699-201ENSMUST00000122340 228 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Gm16227-201ENSMUST00000160088 563 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Gm27149-201ENSMUST00000184716 1266 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Ghrl-205ENSMUST00000204163 447 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Sult2b1-207ENSMUST00000210754 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 AC154433.1-201ENSMUST00000224401 1183 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Defb12-201ENSMUST00000062113 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Gm14524-201ENSMUST00000121066 683 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 1700095J12Rik-201ENSMUST00000124620 737 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Gm5808-201ENSMUST00000178090 357 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Gm38135-201ENSMUST00000195068 502 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Gm36980-201ENSMUST00000195643 622 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 AC116797.2-202ENSMUST00000223587 1017 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 AC102847.1-202ENSMUST00000226313 1245 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Galp-201ENSMUST00000037553 650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Tpi1-203ENSMUST00000149610 802 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Gm29651-201ENSMUST00000189088 697 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Ghrl-203ENSMUST00000203588 237 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Gimap7-201ENSMUST00000052503 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Gm8601-201ENSMUST00000182096 909 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Mir124-2hg-203ENSMUST00000186923 673 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 AC134913.2-201ENSMUST00000225017 771 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
TrioQ0KL02 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms