Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Pate4Q09098 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Pate4Q09098 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms