Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 6430562O15Rik-201ENSMUST00000180491 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Dhx40-201ENSMUST00000018569 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Gm37447-201ENSMUST00000195625 2928 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms