Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Sh3bp2Q06649 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Sh3bp2Q06649 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Sh3bp2Q06649 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Sh3bp2Q06649 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Sh3bp2Q06649 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Sh3bp2Q06649 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Sh3bp2Q06649 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Sh3bp2Q06649 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Sh3bp2Q06649 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Sh3bp2Q06649 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Sh3bp2Q06649 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Gm20822-202ENSMUST00000188422 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Gm20828-202ENSMUST00000190516 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
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Sh3bp2Q06649 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Sh3bp2Q06649 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Sh3bp2Q06649 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Sh3bp2Q06649 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Sh3bp2Q06649 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Sh3bp2Q06649 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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