Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Thbs3Q05895 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Thbs3Q05895 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
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Thbs3Q05895 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Thbs3Q05895 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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