Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Gm11634-201ENSMUST00000154147 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 AC134537.1-201ENSMUST00000219205 265 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Gm16538-201ENSMUST00000162407 442 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Gm8756-201ENSMUST00000183250 929 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 A930036I15Rik-201ENSMUST00000196018 1045 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Klk1b15-ps-201ENSMUST00000206273 715 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Gm3409-202ENSMUST00000110599 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Gm11957-201ENSMUST00000118304 779 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Gm3415-202ENSMUST00000179214 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Gm6644-201ENSMUST00000186507 951 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Gm3409-203ENSMUST00000199142 1167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Gm13981-201ENSMUST00000122360 447 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 1810026B05Rik-208ENSMUST00000190028 590 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Gm4903-201ENSMUST00000210462 405 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Ensa-202ENSMUST00000058230 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Top2aQ01320 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms