Protein–RNA interactions for Protein: P98083

Shc1, SHC-transforming protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc1P98083 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Shc1P98083 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Shc1P98083 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Shc1P98083 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Shc1P98083 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Shc1P98083 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Shc1P98083 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Shc1P98083 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Shc1P98083 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Shc1P98083 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Shc1P98083 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Shc1P98083 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Shc1P98083 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Shc1P98083 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Shc1P98083 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Shc1P98083 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Shc1P98083 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Shc1P98083 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Shc1P98083 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Shc1P98083 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Shc1P98083 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Shc1P98083 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Shc1P98083 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Shc1P98083 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Shc1P98083 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Shc1P98083 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Shc1P98083 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Shc1P98083 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Shc1P98083 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Shc1P98083 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Shc1P98083 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Shc1P98083 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Shc1P98083 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Shc1P98083 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Shc1P98083 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Shc1P98083 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Shc1P98083 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Shc1P98083 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Shc1P98083 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Shc1P98083 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Shc1P98083 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Shc1P98083 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Shc1P98083 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Shc1P98083 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Shc1P98083 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Shc1P98083 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Shc1P98083 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Shc1P98083 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Shc1P98083 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Shc1P98083 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Shc1P98083 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Shc1P98083 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Shc1P98083 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Shc1P98083 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Shc1P98083 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Shc1P98083 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
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