Protein–RNA interactions for Protein: P61089

Ube2n, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2nP61089 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Sdk1-201ENSMUST00000074546 7063 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ube2nP61089 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms