Protein–RNA interactions for Protein: P59016

Vps33b, Vacuolar protein sorting-associated protein 33B, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps33bP59016 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps33bP59016 Gm43167-201ENSMUST00000202001 1606 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps33bP59016 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps33bP59016 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps33bP59016 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps33bP59016 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps33bP59016 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps33bP59016 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps33bP59016 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps33bP59016 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps33bP59016 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps33bP59016 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps33bP59016 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps33bP59016 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vps33bP59016 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Il33-201ENSMUST00000025724 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Gm42970-201ENSMUST00000196407 1352 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Ifitm7-201ENSMUST00000117803 853 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Pax5-209ENSMUST00000165417 1056 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Tex29-204ENSMUST00000166638 561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Ppy-202ENSMUST00000170554 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Gm28096-201ENSMUST00000191391 824 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Gm19918-201ENSMUST00000194858 400 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Gm45812-201ENSMUST00000212199 192 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 AC154407.1-201ENSMUST00000226777 526 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 AC121357.1-201ENSMUST00000227365 608 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Prr19-201ENSMUST00000080288 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Krtap3-3-201ENSMUST00000092700 736 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Selenbp2-204ENSMUST00000173849 1323 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Prss23os-202ENSMUST00000179361 1362 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 AC107763.1-201ENSMUST00000226082 1365 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Gm14113-201ENSMUST00000121399 976 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Gm16547-201ENSMUST00000159474 293 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Gm17190-202ENSMUST00000185178 1074 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Gm28651-201ENSMUST00000185335 644 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Gm8234-201ENSMUST00000198523 1107 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Olfr1358-201ENSMUST00000204477 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Rps2-ps12-201ENSMUST00000214262 785 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 AC134537.1-201ENSMUST00000219205 265 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Tnfrsf18-201ENSMUST00000040274 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Dcpp2-201ENSMUST00000088598 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vps33bP59016 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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