Protein–RNA interactions for Protein: P56389

Cda, Cytidine deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CdaP56389 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CdaP56389 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
CdaP56389 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
CdaP56389 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
CdaP56389 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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CdaP56389 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
CdaP56389 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CdaP56389 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CdaP56389 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
CdaP56389 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
CdaP56389 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CdaP56389 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
CdaP56389 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CdaP56389 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CdaP56389 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CdaP56389 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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CdaP56389 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CdaP56389 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CdaP56389 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CdaP56389 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CdaP56389 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CdaP56389 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CdaP56389 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
CdaP56389 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
CdaP56389 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CdaP56389 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CdaP56389 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
CdaP56389 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CdaP56389 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CdaP56389 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CdaP56389 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CdaP56389 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CdaP56389 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CdaP56389 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
CdaP56389 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CdaP56389 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CdaP56389 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CdaP56389 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
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CdaP56389 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CdaP56389 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CdaP56389 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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CdaP56389 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CdaP56389 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CdaP56389 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CdaP56389 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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CdaP56389 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CdaP56389 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CdaP56389 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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CdaP56389 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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CdaP56389 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
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CdaP56389 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CdaP56389 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CdaP56389 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CdaP56389 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CdaP56389 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CdaP56389 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
CdaP56389 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
CdaP56389 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
CdaP56389 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
CdaP56389 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CdaP56389 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CdaP56389 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CdaP56389 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CdaP56389 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CdaP56389 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CdaP56389 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
CdaP56389 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CdaP56389 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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CdaP56389 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CdaP56389 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CdaP56389 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
CdaP56389 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CdaP56389 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
CdaP56389 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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