Protein–RNA interactions for Protein: P43488

Tnfsf4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf4P43488 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf4P43488 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf4P43488 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf4P43488 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf4P43488 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf4P43488 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf4P43488 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf4P43488 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf4P43488 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf4P43488 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf4P43488 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf4P43488 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf4P43488 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf4P43488 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf4P43488 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf4P43488 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf4P43488 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf4P43488 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf4P43488 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf4P43488 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf4P43488 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf4P43488 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf4P43488 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf4P43488 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf4P43488 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf4P43488 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf4P43488 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf4P43488 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf4P43488 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf4P43488 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf4P43488 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf4P43488 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf4P43488 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf4P43488 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf4P43488 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf4P43488 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf4P43488 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf4P43488 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf4P43488 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf4P43488 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf4P43488 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Tnfsf4P43488 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf4P43488 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf4P43488 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf4P43488 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf4P43488 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf4P43488 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf4P43488 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf4P43488 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf4P43488 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf4P43488 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf4P43488 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf4P43488 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf4P43488 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf4P43488 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf4P43488 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf4P43488 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf4P43488 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf4P43488 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf4P43488 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf4P43488 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf4P43488 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf4P43488 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf4P43488 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf4P43488 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf4P43488 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf4P43488 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf4P43488 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf4P43488 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf4P43488 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf4P43488 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf4P43488 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf4P43488 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf4P43488 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf4P43488 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf4P43488 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf4P43488 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf4P43488 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf4P43488 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf4P43488 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf4P43488 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf4P43488 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf4P43488 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf4P43488 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf4P43488 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf4P43488 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf4P43488 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf4P43488 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf4P43488 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Tnfsf4P43488 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf4P43488 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf4P43488 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf4P43488 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf4P43488 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf4P43488 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf4P43488 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf4P43488 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf4P43488 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf4P43488 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Tnfsf4P43488 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms