Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
TtlP38585 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
TtlP38585 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TtlP38585 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TtlP38585 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TtlP38585 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TtlP38585 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TtlP38585 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TtlP38585 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TtlP38585 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
TtlP38585 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
TtlP38585 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TtlP38585 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TtlP38585 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TtlP38585 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TtlP38585 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TtlP38585 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TtlP38585 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TtlP38585 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TtlP38585 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TtlP38585 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
TtlP38585 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
TtlP38585 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TtlP38585 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
TtlP38585 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TtlP38585 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TtlP38585 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
TtlP38585 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TtlP38585 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TtlP38585 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TtlP38585 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TtlP38585 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TtlP38585 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TtlP38585 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TtlP38585 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TtlP38585 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TtlP38585 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TtlP38585 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TtlP38585 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TtlP38585 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TtlP38585 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TtlP38585 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TtlP38585 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
TtlP38585 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
TtlP38585 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
TtlP38585 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
TtlP38585 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
TtlP38585 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
TtlP38585 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
TtlP38585 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
TtlP38585 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
TtlP38585 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
TtlP38585 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TtlP38585 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TtlP38585 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TtlP38585 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TtlP38585 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TtlP38585 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TtlP38585 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TtlP38585 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TtlP38585 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TtlP38585 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TtlP38585 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TtlP38585 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TtlP38585 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TtlP38585 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TtlP38585 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TtlP38585 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TtlP38585 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TtlP38585 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TtlP38585 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TtlP38585 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TtlP38585 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TtlP38585 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TtlP38585 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TtlP38585 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TtlP38585 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TtlP38585 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TtlP38585 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TtlP38585 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TtlP38585 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TtlP38585 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TtlP38585 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TtlP38585 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TtlP38585 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TtlP38585 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TtlP38585 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TtlP38585 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TtlP38585 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TtlP38585 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TtlP38585 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TtlP38585 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TtlP38585 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TtlP38585 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TtlP38585 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
TtlP38585 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TtlP38585 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
TtlP38585 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TtlP38585 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
TtlP38585 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms