Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Hoxc11P31313 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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