Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VtnP29788 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
VtnP29788 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VtnP29788 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
VtnP29788 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
VtnP29788 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
VtnP29788 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VtnP29788 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VtnP29788 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VtnP29788 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VtnP29788 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VtnP29788 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VtnP29788 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
VtnP29788 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VtnP29788 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VtnP29788 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VtnP29788 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VtnP29788 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VtnP29788 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
VtnP29788 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
VtnP29788 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VtnP29788 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
VtnP29788 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VtnP29788 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
VtnP29788 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VtnP29788 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
VtnP29788 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VtnP29788 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VtnP29788 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
VtnP29788 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
VtnP29788 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VtnP29788 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VtnP29788 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
VtnP29788 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VtnP29788 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VtnP29788 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VtnP29788 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
VtnP29788 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
VtnP29788 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VtnP29788 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
VtnP29788 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
VtnP29788 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
VtnP29788 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
VtnP29788 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
VtnP29788 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VtnP29788 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
VtnP29788 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
VtnP29788 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VtnP29788 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
VtnP29788 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
VtnP29788 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
VtnP29788 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
VtnP29788 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
VtnP29788 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
VtnP29788 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
VtnP29788 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VtnP29788 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
VtnP29788 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
VtnP29788 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
VtnP29788 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VtnP29788 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
VtnP29788 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
VtnP29788 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VtnP29788 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
VtnP29788 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VtnP29788 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VtnP29788 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VtnP29788 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
VtnP29788 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VtnP29788 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VtnP29788 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VtnP29788 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VtnP29788 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VtnP29788 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VtnP29788 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VtnP29788 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
VtnP29788 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
VtnP29788 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
VtnP29788 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VtnP29788 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VtnP29788 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VtnP29788 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VtnP29788 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
VtnP29788 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VtnP29788 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VtnP29788 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VtnP29788 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VtnP29788 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VtnP29788 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VtnP29788 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VtnP29788 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VtnP29788 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
VtnP29788 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VtnP29788 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VtnP29788 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
VtnP29788 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
VtnP29788 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
VtnP29788 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
VtnP29788 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
VtnP29788 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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