Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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PdgfraP26618 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
PdgfraP26618 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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