Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

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Length 672 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PrkcaP20444 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PrkcaP20444 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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