Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Gm25355-201ENSMUST00000178456 101 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Gm24975-201ENSMUST00000178492 101 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Gm23189-201ENSMUST00000178954 102 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Gm25100-201ENSMUST00000179750 101 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Gm23064-201ENSMUST00000179866 101 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Gm43726-201ENSMUST00000199110 775 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Timm9-210ENSMUST00000221892 734 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Gm6331-201ENSMUST00000217890 450 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Gm6564-201ENSMUST00000075377 619 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Olfr372-201ENSMUST00000093434 1016 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Tipin-205ENSMUST00000216594 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Ighv5-15-201ENSMUST00000103457 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Ebi3-201ENSMUST00000003274 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 P2rx1-202ENSMUST00000092938 1119 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Ighv1-5-201ENSMUST00000103494 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Tex33-203ENSMUST00000169575 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Cryab-205ENSMUST00000216755 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Fthl17e-201ENSMUST00000096509 841 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Sptan1P16546 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
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