Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 6430573F11Rik-203ENSMUST00000147525 5820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Traf1-207ENSMUST00000172159 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Dcun1d2-202ENSMUST00000110838 2955 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Zfp275-201ENSMUST00000033731 6376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Med12l-206ENSMUST00000199659 11006 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Stau1-202ENSMUST00000109235 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Tgfbrap1-201ENSMUST00000095014 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Dync1h1-201ENSMUST00000018851 14342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Ap5z1-201ENSMUST00000038699 3689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Smad2-201ENSMUST00000025453 2410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Gm42826-201ENSMUST00000197548 2639 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 C1rl-201ENSMUST00000049124 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Fam210a-201ENSMUST00000042852 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Vpreb1P13372 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Sap30bpos-201ENSMUST00000132264 2352 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Gm45889-202ENSMUST00000211255 2358 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC7.59□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Igf2bp3-201ENSMUST00000031838 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Zfp324-201ENSMUST00000038701 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Ano2-204ENSMUST00000160496 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Il17rd-201ENSMUST00000035336 8280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Gne-201ENSMUST00000030201 5384 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Zfyve1-201ENSMUST00000048319 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Efna5-201ENSMUST00000076840 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Myh10-201ENSMUST00000018887 7667 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Synpo2l-203ENSMUST00000119483 3696 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Pms2-209ENSMUST00000148011 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Sf3b5-201ENSMUST00000105139 3841 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Vpreb1P13372 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms