Protein–RNA interactions for Protein: O35451

Atf6b, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6bO35451 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Atf6bO35451 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Atf6bO35451 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Atf6bO35451 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Atf6bO35451 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Atf6bO35451 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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