Protein–RNA interactions for Protein: O35367

Kera, Keratocan, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KeraO35367 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
KeraO35367 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
KeraO35367 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
KeraO35367 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
KeraO35367 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
KeraO35367 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
KeraO35367 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
KeraO35367 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
KeraO35367 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
KeraO35367 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
KeraO35367 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
KeraO35367 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
KeraO35367 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
KeraO35367 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
KeraO35367 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
KeraO35367 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
KeraO35367 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
KeraO35367 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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KeraO35367 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
KeraO35367 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
KeraO35367 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
KeraO35367 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
KeraO35367 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
KeraO35367 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
KeraO35367 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
KeraO35367 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
KeraO35367 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
KeraO35367 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
KeraO35367 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
KeraO35367 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
KeraO35367 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
KeraO35367 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
KeraO35367 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
KeraO35367 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
KeraO35367 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
KeraO35367 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
KeraO35367 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
KeraO35367 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
KeraO35367 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
KeraO35367 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
KeraO35367 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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KeraO35367 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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KeraO35367 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
KeraO35367 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
KeraO35367 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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KeraO35367 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
KeraO35367 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
KeraO35367 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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KeraO35367 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
KeraO35367 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
KeraO35367 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
KeraO35367 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
KeraO35367 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
KeraO35367 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
KeraO35367 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
KeraO35367 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
KeraO35367 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
KeraO35367 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
KeraO35367 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
KeraO35367 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
KeraO35367 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
KeraO35367 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
KeraO35367 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
KeraO35367 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
KeraO35367 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
KeraO35367 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
KeraO35367 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
KeraO35367 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
KeraO35367 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
KeraO35367 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
KeraO35367 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
KeraO35367 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
KeraO35367 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
KeraO35367 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
KeraO35367 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
KeraO35367 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
KeraO35367 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
KeraO35367 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
KeraO35367 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.2 ms