Protein–RNA interactions for Protein: O35348

Colq, Acetylcholinesterase collagenic tail peptide, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ColqO35348 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ColqO35348 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ColqO35348 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
ColqO35348 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ColqO35348 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
ColqO35348 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 4921534H16Rik-201ENSMUST00000162370 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Gm20756-201ENSMUST00000201080 1595 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Gm42432-201ENSMUST00000197902 1617 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Ighv1-74-201ENSMUST00000103543 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Gm12470-201ENSMUST00000117239 1049 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Olfr1296-ps1-201ENSMUST00000117697 939 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Gm15707-201ENSMUST00000118804 996 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Cdk1-202ENSMUST00000119827 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Sycp3-203ENSMUST00000125612 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Spata3-205ENSMUST00000130504 1100 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Gm14320-201ENSMUST00000137275 1023 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Gm15346-201ENSMUST00000143638 475 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Gm6611-201ENSMUST00000163830 1272 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Gm18397-201ENSMUST00000176704 587 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Milr1-207ENSMUST00000182908 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Gm28298-201ENSMUST00000185287 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Gm28127-201ENSMUST00000185293 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Gm29318-201ENSMUST00000185308 975 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Gm28176-201ENSMUST00000185322 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Gm29532-201ENSMUST00000185593 622 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Gm29315-201ENSMUST00000185844 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Gm29581-201ENSMUST00000186083 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Gm28296-202ENSMUST00000186151 622 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Gm29210-201ENSMUST00000186332 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Gm29498-201ENSMUST00000186449 537 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Gm28761-201ENSMUST00000186540 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Gm28170-201ENSMUST00000186892 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Gm28326-201ENSMUST00000187043 622 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Gm28073-201ENSMUST00000187174 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Gm28725-201ENSMUST00000187372 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Gm28301-201ENSMUST00000187582 537 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Gm28464-201ENSMUST00000187726 622 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Gm29655-201ENSMUST00000187728 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Gm28280-201ENSMUST00000188196 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Gm28295-201ENSMUST00000188322 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Gm28091-201ENSMUST00000188421 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Gm29215-202ENSMUST00000188659 621 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Gm28697-202ENSMUST00000188821 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Gm28521-201ENSMUST00000188948 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Gm28850-201ENSMUST00000189058 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Gm28300-202ENSMUST00000189170 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Gm28690-202ENSMUST00000190325 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Gm28456-202ENSMUST00000190521 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Gm28834-202ENSMUST00000190714 537 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 5031425E22Rik-205ENSMUST00000191186 719 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Gm28325-202ENSMUST00000191481 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Gm29132-202ENSMUST00000191588 622 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Gm30174-201ENSMUST00000191682 537 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Gm36261-201ENSMUST00000191807 537 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Gm35070-201ENSMUST00000192589 621 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Gm6606-201ENSMUST00000193613 947 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Gm34550-202ENSMUST00000195186 537 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Gm30686-202ENSMUST00000195371 621 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Gm30353-202ENSMUST00000195486 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Gm36467-202ENSMUST00000195606 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Gm43674-201ENSMUST00000196313 791 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Gm42720-201ENSMUST00000196813 300 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Ckb-ps2-201ENSMUST00000198886 1001 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Gm43342-201ENSMUST00000201027 924 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Gm43905-201ENSMUST00000204516 204 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Kcne3-206ENSMUST00000207995 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Gm45335-201ENSMUST00000210618 401 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Ccdc114-205ENSMUST00000211367 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 AC164123.1-201ENSMUST00000213385 447 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Olfr1092-ps1-201ENSMUST00000216544 398 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 1700042O05Rik-201ENSMUST00000219017 584 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Mustn1-201ENSMUST00000040715 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Olfr1472-201ENSMUST00000077501 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Olfr1475-201ENSMUST00000080801 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Vmn1r201-201ENSMUST00000091730 903 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
ColqO35348 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms