Protein–RNA interactions for Protein: J3QNX5

Shisa8, Cysteine-knot AMPAR-modulating protein 39, mousemouse

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa8J3QNX5 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Shisa8J3QNX5 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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