Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Gm8894-201ENSMUST00000074642 666 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ScaperF8VQ70 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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