Protein–RNA interactions for Protein: F6VKC7

Zfp988, Zinc finger protein 988, mousemouse

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Length 633 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp988F6VKC7 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
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Zfp988F6VKC7 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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Zfp988F6VKC7 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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Zfp988F6VKC7 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Zfp988F6VKC7 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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