Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Camk2a-204ENSMUST00000115295 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Gm15015-201ENSMUST00000135491 636 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Gm15020-201ENSMUST00000147142 636 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Fbxo16-201ENSMUST00000169656 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Gm5873-201ENSMUST00000177157 1066 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Gm4960-201ENSMUST00000182928 1001 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Gm38135-201ENSMUST00000195068 502 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Gm44304-201ENSMUST00000200509 145 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Gm29328-212ENSMUST00000209182 1168 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Gm9619-201ENSMUST00000211587 762 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Epha6-203ENSMUST00000161358 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Sfxn1-201ENSMUST00000021930 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Cep70-207ENSMUST00000190715 1768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Gm23129-201ENSMUST00000104259 132 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Psme2-201ENSMUST00000111378 795 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Ccl19-ps1-201ENSMUST00000119621 327 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Tcl1-203ENSMUST00000175652 535 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Gm7815-201ENSMUST00000196104 832 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Enpp7-201ENSMUST00000092373 1370 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fndc1E9Q043 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 H2afy3-201ENSMUST00000151919 1112 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Gm8525-201ENSMUST00000189674 861 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Gm44173-201ENSMUST00000204316 132 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Nudc-ps1-201ENSMUST00000209275 551 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 1700016D06Rik-201ENSMUST00000033906 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Ankrd45-201ENSMUST00000052245 849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Spata16-202ENSMUST00000108305 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Gm8725-201ENSMUST00000221829 1333 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Gm30504-201ENSMUST00000209316 1688 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Pole-202ENSMUST00000112481 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Gm13580-201ENSMUST00000131457 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Gm25154-201ENSMUST00000157123 119 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 1700026J14Rik-201ENSMUST00000180937 794 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Gm3527-201ENSMUST00000198905 460 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fndc1E9Q043 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms