Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Gm3543D3Z235 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Gm3543D3Z235 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Gm3543D3Z235 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Gm3543D3Z235 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Gm3543D3Z235 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Gm3543D3Z235 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3543D3Z235 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
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