Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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PtprbB2RU80 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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PtprbB2RU80 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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PtprbB2RU80 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
PtprbB2RU80 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms