Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Spocd1B1ASB6 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Spocd1B1ASB6 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms