Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Atp8b5A3FIN4 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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