Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
CcniQ9Z2V9 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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