Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

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Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hdac6Q9Z2V5 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hdac6Q9Z2V5 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hdac6Q9Z2V5 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hdac6Q9Z2V5 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hdac6Q9Z2V5 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hdac6Q9Z2V5 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hdac6Q9Z2V5 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hdac6Q9Z2V5 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hdac6Q9Z2V5 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hdac6Q9Z2V5 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hdac6Q9Z2V5 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hdac6Q9Z2V5 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Hdac6Q9Z2V5 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Hdac6Q9Z2V5 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hdac6Q9Z2V5 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hdac6Q9Z2V5 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Hdac6Q9Z2V5 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hdac6Q9Z2V5 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hdac6Q9Z2V5 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Hdac6Q9Z2V5 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Hdac6Q9Z2V5 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hdac6Q9Z2V5 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Hdac6Q9Z2V5 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Hdac6Q9Z2V5 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hdac6Q9Z2V5 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hdac6Q9Z2V5 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hdac6Q9Z2V5 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Hdac6Q9Z2V5 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Hdac6Q9Z2V5 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hdac6Q9Z2V5 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hdac6Q9Z2V5 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hdac6Q9Z2V5 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hdac6Q9Z2V5 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Hdac6Q9Z2V5 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hdac6Q9Z2V5 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hdac6Q9Z2V5 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hdac6Q9Z2V5 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Hdac6Q9Z2V5 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hdac6Q9Z2V5 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hdac6Q9Z2V5 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hdac6Q9Z2V5 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hdac6Q9Z2V5 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Hdac6Q9Z2V5 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hdac6Q9Z2V5 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Hdac6Q9Z2V5 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Hdac6Q9Z2V5 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hdac6Q9Z2V5 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hdac6Q9Z2V5 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hdac6Q9Z2V5 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hdac6Q9Z2V5 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hdac6Q9Z2V5 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hdac6Q9Z2V5 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hdac6Q9Z2V5 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hdac6Q9Z2V5 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hdac6Q9Z2V5 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hdac6Q9Z2V5 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hdac6Q9Z2V5 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hdac6Q9Z2V5 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Hdac6Q9Z2V5 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac6Q9Z2V5 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac6Q9Z2V5 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac6Q9Z2V5 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac6Q9Z2V5 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac6Q9Z2V5 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac6Q9Z2V5 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac6Q9Z2V5 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac6Q9Z2V5 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac6Q9Z2V5 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac6Q9Z2V5 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac6Q9Z2V5 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Hdac6Q9Z2V5 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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