Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Wdr54Q9R0D8 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Wdr54Q9R0D8 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Wdr54Q9R0D8 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Wdr54Q9R0D8 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Wdr54Q9R0D8 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Wdr54Q9R0D8 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Wdr54Q9R0D8 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Wdr54Q9R0D8 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Wdr54Q9R0D8 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Wdr54Q9R0D8 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Wdr54Q9R0D8 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Wdr54Q9R0D8 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Wdr54Q9R0D8 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Wdr54Q9R0D8 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Wdr54Q9R0D8 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Wdr54Q9R0D8 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Wdr54Q9R0D8 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Wdr54Q9R0D8 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Wdr54Q9R0D8 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Wdr54Q9R0D8 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Wdr54Q9R0D8 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Wdr54Q9R0D8 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Wdr54Q9R0D8 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Wdr54Q9R0D8 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Wdr54Q9R0D8 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Wdr54Q9R0D8 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Wdr54Q9R0D8 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Wdr54Q9R0D8 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Wdr54Q9R0D8 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Wdr54Q9R0D8 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Wdr54Q9R0D8 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Wdr54Q9R0D8 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Wdr54Q9R0D8 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Wdr54Q9R0D8 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Wdr54Q9R0D8 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Wdr54Q9R0D8 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Wdr54Q9R0D8 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Wdr54Q9R0D8 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Wdr54Q9R0D8 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Wdr54Q9R0D8 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Wdr54Q9R0D8 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Wdr54Q9R0D8 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Wdr54Q9R0D8 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Wdr54Q9R0D8 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Wdr54Q9R0D8 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Wdr54Q9R0D8 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Wdr54Q9R0D8 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Wdr54Q9R0D8 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Wdr54Q9R0D8 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Wdr54Q9R0D8 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Wdr54Q9R0D8 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Wdr54Q9R0D8 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Wdr54Q9R0D8 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Wdr54Q9R0D8 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Wdr54Q9R0D8 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Wdr54Q9R0D8 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Wdr54Q9R0D8 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Wdr54Q9R0D8 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Wdr54Q9R0D8 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Wdr54Q9R0D8 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Wdr54Q9R0D8 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Wdr54Q9R0D8 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Wdr54Q9R0D8 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Wdr54Q9R0D8 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Wdr54Q9R0D8 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Wdr54Q9R0D8 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Wdr54Q9R0D8 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Wdr54Q9R0D8 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Wdr54Q9R0D8 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Wdr54Q9R0D8 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Wdr54Q9R0D8 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Wdr54Q9R0D8 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Wdr54Q9R0D8 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Wdr54Q9R0D8 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Wdr54Q9R0D8 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Wdr54Q9R0D8 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Wdr54Q9R0D8 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Wdr54Q9R0D8 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Wdr54Q9R0D8 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Wdr54Q9R0D8 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Wdr54Q9R0D8 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Wdr54Q9R0D8 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Wdr54Q9R0D8 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Wdr54Q9R0D8 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Wdr54Q9R0D8 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Wdr54Q9R0D8 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Wdr54Q9R0D8 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Wdr54Q9R0D8 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Wdr54Q9R0D8 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Wdr54Q9R0D8 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Wdr54Q9R0D8 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Wdr54Q9R0D8 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Wdr54Q9R0D8 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Wdr54Q9R0D8 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Wdr54Q9R0D8 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Wdr54Q9R0D8 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Wdr54Q9R0D8 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Wdr54Q9R0D8 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Wdr54Q9R0D8 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.6 ms