Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Gde1Q9JL56 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms