Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS5

Habp4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Habp4Q9JKS5 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 2610318N02Rik-202ENSMUST00000207116 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 AC121357.1-201ENSMUST00000227365 608 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Gm14055-201ENSMUST00000130262 668 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Selenos-204ENSMUST00000206044 911 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Gm13286-201ENSMUST00000117750 537 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Habp4Q9JKS5 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.5 ms